En 1987, la Fundación Omacha inicia sus investigaciones con los delfines de río: el bufeo (Inia geoffrensis) y el tucuxi (Sotalia fluviatilis), en el amazonas. Posteriormente se incluyeron otras especies como los manatíes (Trichechus inunguis) y los lobos de río (Pteonura brasiliensis). En 1993, se construyó el Centro de Investigaciones en el municipio de Puerto Nariño.
La Fundación Omacha, a partir del año 1994, realizó estudios sobre delfines costeros (Tursiops truncatus) y (Sotalia guianensis), en la zona del golfo de Morrosquillo, para evaluar su distribución y el uso de hábitat y el comportamiento en el Golfo.