1. Plan de conservación de la pava caucana (Penelope perspicax) en la región del SIRAP-EC y Valle del Cauca
  2. Estrategia Nacional para la conservación de las aves 
  3. Estrategia Nacional para la conservación de las plantas 
  4. Estrategia Ecoregional para la conservación del Oso Andino en los Andes del Norte 
  5. Evaluación de la distribución potencial actual en Colombia del cedro (Cedrela odorata) y el cocolobo (Dalbergia sp), especies incluidas en apéndices CITES y recomendaciones para el manejo in situ de sus poblaciones
  6. Especies focales de aves de Cundinamarca: estrategias para la conservación 
  7. Important Bird Areas Americas – Priority sites for biodiversity conservation in Colombia.
  8. Especies focales para la conservación en el departamento de Córdoba. 
  9. Plan Nacional de especies migratorias
  10. Plan de Manejo orientado al uso sostenible de la tortuga hicotea
  11. Estrategia Nacional para la prevención y el control del tráfico ilegal de especies silvestres
  12. Áreas de anidación y de alimentación de las tortugas marinas en el Caribe colombiano
  13. Programa Nacional para la conservación del caimán andino
  14. Programa nacional para la conservación del condor llanero
  15. Áreas de anidación y de alimentación de las tortugas marinas en el Caribe colombiano
  16. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Las Hermosas
  17. Plan de Manejo Santuario de Fauna y Flora Iguaque 
  18. Plan de Manejo Santuario de Fauna y Flora Guanetá Alto Río Fonce 
  19. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Tama 
  20. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Cocuy 
  21. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Catatumbo-Bari 
  22. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Los Nevados
  23. Plan de Manejo Santuario de Fauna y Flora Otún-Quimbaya 
  24. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Utria 
  25. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Orquideas 
  26. Plan de Manejo Santuario de Fauna y Flora Malpelo 
  27. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Katios 
  28. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Gorgona 
  29. Plan de Manejo Área Natural Unica Los Estoraques 
  30. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Tatamá
  31. Plan de Manejo Parque Nacional Natural Pisba